Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

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Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
AGRNO00468 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
AGRNO00468 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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