Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN6

DIRC3, Disrupted in renal carcinoma 3, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DIRC3C9JPN6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
DIRC3C9JPN6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
DIRC3C9JPN6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms