Protein–RNA interactions for Protein: A8MTJ6

FOXI3, Forkhead box protein I3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI3A8MTJ6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FOXI3A8MTJ6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FOXI3A8MTJ6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms