Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC78A2IDD5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms