Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBA6A0AVT1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms