Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CHTOPQ9Y3Y2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GNAL-203ENST00000423027 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms