Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
HCN4Q9Y3Q4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms