Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR1DQ9Y2S0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms