Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RCE1Q9Y256 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RCE1Q9Y256 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms