Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HDAC5Q9UQL6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms