Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
INO80Q9ULG1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
INO80Q9ULG1 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms