Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
MRTO4Q9UKD2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms