Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RIMS3Q9UJD0 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms