Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MED13Q9UHV7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MED13Q9UHV7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms