Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IFT172Q9UG01 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms