Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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MIS18AQ9NYP9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
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MIS18AQ9NYP9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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