Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PGPEP1Q9NXJ5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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