Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CLN6Q9NWW5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLN6Q9NWW5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms