Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ATAD3AQ9NVI7 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms