Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CLMPQ9H6B4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms