Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GFRA4Q9GZZ7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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