Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PHACTR1Q9C0D0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PHACTR1Q9C0D0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms