Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TRIM8Q9BZR9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms