Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GSDMCQ9BYG8 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GSDMCQ9BYG8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms