Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
MAP1LC3CQ9BXW4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms