Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
RNF17Q9BXT8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RNF17Q9BXT8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms