Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TDRD1Q9BXT4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms