Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
POLR3CQ9BUI4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
POLR3CQ9BUI4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms