Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
USB1Q9BQ65 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms