Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NIPSNAP1Q9BPW8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NIPSNAP1Q9BPW8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms