Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SH3GL3Q99963 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3GL3Q99963 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3GL3Q99963 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SH3GL3Q99963 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms