Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RGPD5Q99666 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms