Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CITED4Q96RK1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CITED4Q96RK1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms