Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 RTN1-203ENST00000395090 1609 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PHF12Q96QT6 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms