Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SAMD8Q96LT4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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