Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SIRT1Q96EB6 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms