Protein–RNA interactions for Protein: Q969K3

RNF34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF34Q969K3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RNF34Q969K3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RNF34Q969K3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms