Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RABGGTAQ92696 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms