Protein–RNA interactions for Protein: Q92616

GCN1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1Q92616 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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GCN1Q92616 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GCN1Q92616 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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