Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SYDE1Q6ZW31 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SYDE1Q6ZW31 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms