Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF544Q6NX49 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF544Q6NX49 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms