Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
INTS3Q68E01 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
INTS3Q68E01 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms