Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC158Q5M9N0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC158Q5M9N0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms