Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNNI3KQ59H18 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms