Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
PCK2Q16822 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PCK2Q16822 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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