Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ZNF239Q16600 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF239Q16600 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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