Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLC18A3Q16572 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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