Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NTRK3Q16288 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NTRK3Q16288 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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