Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CACNA1EQ15878 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms