Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USF2Q15853 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USF2Q15853 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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